RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 CASQ1P31415 396 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 PSMC5P62195 406 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 ACTBL2Q562R1 376 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 FBXO48Q5FWF7 155 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 Q6ZRU5 148 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 FAM58AQ8N1B3 248 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 DNAAF3Q8N9W5 541 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 SPERTQ8NA61 448 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 MFSD8Q8NHS3 518 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 CHID1Q9BWS9 393 aa2.09□□□□□ -2.07
SGCE-210ENST00000472326 NRCAMQ92823 1304 aa2.09□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 MED13Q9UHV7 2174 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CD300LBA8K4G0 201 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 ZNF879B4DU55 563 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CCDC172P0C7W6 258 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CARD18P57730 90 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 TAL2Q16559 108 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 GLYATQ6IB77 296 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 SCXQ7RTU7 201 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CA13Q8N1Q1 262 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 GAPTQ8N292 157 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 ATPAF2Q8N5M1 289 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 LRRC39Q96DD0 335 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 BEX2Q9BXY8 128 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 SLC22A14Q9Y267 594 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.08□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 RTTNQ86VV8 2226 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 NAV1Q8NEY1 1877 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 MYH1P12882 1939 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 EML5Q05BV3 1969 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GTI1 187 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 M0QX08 132 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 KDELR3O43731 214 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 STAG3L2P0CL84 134 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CD52P31358 61 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 BNIP2Q12982 314 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CEACAM16Q2WEN9 425 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 C16orf87Q6PH81 154 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 OR13C9Q8NGT0 318 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CCL17Q92583 94 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 FGF13Q92913 245 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 MSANTD3Q96H12 275 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 LINC01587Q99440 93 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 FBXO44Q9H4M3 255 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 STAB1Q9NY15 2570 aa2.07□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 RBFOX3A6NFN3 312 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 TVP23AA6NH52 213 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 E7EWF7 191 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 M0QZ92 97 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 GPR75O95800 540 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CSTAP01040 98 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 TPM1P09493 284 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 GPR4P46093 362 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 PYCR3Q53H96 274 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 NIPAL1Q6NVV3 410 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 TPGS1Q6ZTW0 290 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CYP4Z1Q86W10 505 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 TTTY12Q9BZ98 90 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 PI4KAP42356 2102 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 F5P12259 2224 aa2.06□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 FOCADQ5VW36 1801 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 APCP25054 2843 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 MYH8P13535 1937 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 NBASA2RRP1 2371 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CUBNO60494 3623 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 OR5H14A6NHG9 310 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 C17orf98A8MV24 154 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 YKT6O15498 198 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 GATCO43716 136 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 SH2D1AO60880 128 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 POP7O75817 140 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 APOA1P02647 267 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 CECR9P0C854 216 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 PRTN3P24158 256 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 HADHBP55084 474 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 MGAT3Q09327 533 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 ASCL4Q6XD76 172 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP18Q8N392 663 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 OTUD6BQ8N6M0 293 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 PPTC7Q8NI37 304 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 DNAJB3Q8WWF6 145 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 HAUS4Q9H6D7 363 aa2.05□□□□□ -2.08
SGCE-210ENST00000472326 IFNKQ9P0W0 207 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms