RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 OR8U1Q8NH10 309 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 R3HDM4Q96D70 268 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 GINS4Q9BRT9 223 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 DIABLOQ9NR28 239 aa7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SYN3-211ENST00000472027 A0A0A6YYH2 397 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR5H14A6NHG9 310 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 A6NJ64 397 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 H7C2Y5 167 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 M0R1X1 148 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NBR2O15453 112 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 KCNAB3O43448 404 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SSX5O60225 188 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NDUFA3O95167 84 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TFAP2AP05549 437 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CTXN2P0C2S0 81 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SMIM18P0DKX4 95 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NCS1P62166 190 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SLC35B1P78383 322 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 LIN54Q6MZP7 749 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF383Q8NA42 475 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR4F4Q96R69 305 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RNF5Q99942 180 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 GON7Q9BXV9 100 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR2D2Q9H210 308 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 KIAA1456Q9P272 454 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FBN3Q75N90 2809 aa7.21□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 J3QRK9 145 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGF1P05019 195 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 VBP1P61758 197 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TEX38Q6PEX7 206 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CNIH2Q6PI25 160 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 COMMD1Q8N668 190 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZFP57Q9NU63 452 aa7.2□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FCN1O00602 326 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RRHO14718 337 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 XRCC3O43542 346 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RBBP9O75884 186 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DRB1P01911 266 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 APOA2P02652 100 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGKV1-16P04430 117 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PF4V1P10720 104 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PTHLHP12272 177 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 VDAC1P21796 283 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 DEFA6Q01524 100 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PSG5Q15238 335 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 HOGA1Q86XE5 327 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PDPNQ86YL7 162 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 C5orf30Q96GV9 206 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR51J1Q9H342 316 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FBXL15Q9H469 300 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.19□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 G3V318 75 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 G3V4G9 280 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 IGHG4P01861 327 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 HLA-DQB1P01920 261 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 FCER2P06734 321 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ELANEP08246 267 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 OR5H8P0DN80 308 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ALDH3B2P48448 385 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 THBS3P49746 956 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RORCP51449 518 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CX3CL1P78423 397 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CFHR3Q02985 330 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 PLGLAQ15195 96 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 CTF1Q16619 201 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 GPR107Q5VW38 600 aa7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SYN3-211ENST00000472027 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.18□□□□□ -1.26
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