RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	IFT46	Q9NQC8	304 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		14.11	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FAM25A	B3EWG3	89 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FAM25C	B3EWG5	89 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FAM25G	B3EWG6	89 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902		M0R1X1	148 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	APOA1	P02647	267 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CT45A6	P0DMU7	189 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CT45A5	P0DMU8	189 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CT45A7	P0DMV0	189 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	SOX6	P35712	828 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	F2RL1	P55085	397 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	MMD	Q15546	238 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	PRR31	Q5SQ13	230 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902		Q8N6K4	173 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		14.1	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	FBXO24	O75426	580 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	MC5R	P33032	325 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	CBX5	P45973	191 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	TMBIM6	P55061	237 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	ACTB	P60709	375 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	SPCS2	Q15005	226 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	HOGA1	Q86XE5	327 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902		Q8N9W7	124 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		14.09	□□□□□ -0.15
USP19-210	ENST00000465902	OR5H14	A6NHG9	310 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902		M0QZ24	198 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	ELK1	P19419	428 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	PRSS3	P35030	304 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	RITA1	Q96K30	269 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CMTM3	Q96MX0	182 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1456	Q9P272	454 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		14.08	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CCDC160	A6NGH7	325 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902		H0YJW9	148 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	PROP1	O75360	226 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	APOA2	P02652	100 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CD28	P10747	220 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CNTFR	P26992	372 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	LINC00205	P59089	165 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		14.07	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	PLXNB1	O43157	2135 aa		14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	NBR2	O15453	112 aa		14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	RGS5	O15539	181 aa		14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	PLGLA	Q15195	96 aa		14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	ZNF383	Q8NA42	475 aa		14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		14.06	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	IGHG2	P01859	326 aa		14.05	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	FCGR2C	P31995	323 aa		14.05	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		14.05	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		14.05	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		14.05	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	GAB2	Q9UQC2	676 aa		14.05	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	PSMB11	A5LHX3	300 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	LINC01548	A6NM66	108 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	KCNAB3	O43448	404 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	TUSC2	O75896	110 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DQB1	P01920	261 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	OR5H8	P0DN80	308 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CBX3	Q13185	183 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	ZNF329	Q86UD4	541 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	SNAPC3	Q92966	411 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	ISOC1	Q96CN7	298 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	VWF	P04275	2813 aa		14.04	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902		H3BMQ9	156 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	AP4M1	O00189	453 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	RBBP9	O75884	186 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CSF1	P09603	554 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	THBS3	P49746	956 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	CDK10	Q15131	360 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		14.03	□□□□□ -0.16
USP19-210	ENST00000465902	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		14.03	□□□□□ -0.16

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