RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 FABP7O15540 132 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF16O43320 207 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 AIREO43918 545 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 FCER2P06734 321 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CSF1P09603 554 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IL3RAP26951 378 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGDIBP52566 201 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTBP60709 375 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 VBP1P61758 197 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NCS1P62166 190 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NDPQ00604 133 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM131AQ6UXB0 335 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF383Q8NA42 475 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP27Q9H306 513 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB9BQ9NP90 201 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf4Q9NQ89 552 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ABRACLQ9P1F3 81 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL21EPA6NDL7 271 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB29O14966 203 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA12AO43301 675 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS11O94810 467 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA3O95167 84 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV2-14P01704 120 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TFAP2AP05549 437 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8U9P0C7N5 309 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB25P24278 435 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR12P47775 334 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH3B2P48448 385 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFA6Q01524 100 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CFHR3Q02985 330 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ARFRP1Q13795 201 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 HACD4Q5VWC8 232 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZS49 121 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 STPG2Q8N412 459 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OR8U1Q8NH10 309 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL15Q9H469 300 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA2Q9UM82 520 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 GAB2Q9UQC2 676 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NOTCH1P46531 2555 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMB11A5LHX3 300 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00473A8K010 186 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 G3V318 75 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 M0QZK8 103 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNL1O43396 289 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV2-23P01705 113 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 OPN1MWP04001 364 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-16P04430 117 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CD33P20138 364 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 DTYMKP23919 212 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB10P48595 397 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MMDQ15546 238 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CTF1Q16619 201 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 NPBQ8NG41 125 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 R3HDM4Q96D70 268 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOVQ96L33 236 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-206ENST00000461017 DUX3Q96PT4 197 aa5.49□□□□□ -1.53
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