RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.87□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.87□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0G2JLM5 398 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 IRGMA1A4Y4 181 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 H3BNX3 289 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 DYNC1I1O14576 645 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A17O43808 307 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 APOA2P02652 100 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 CD81P60033 236 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 PSG5Q15238 335 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 RPEL1Q2QD12 228 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 Q8N402 240 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 SVOPQ8N4V2 548 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 COA4Q9NYJ1 87 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC42Q9Y546 428 aa7.86□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 SHISA3A0PJX4 238 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 SPDEFO95238 335 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 APELAP0DMC3 54 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 TATDN3Q17R31 274 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 OR10K2Q6IF99 312 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 DERL3Q96Q80 235 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 PHB2Q99623 299 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 SLC29A1Q99808 456 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 KCNK15Q9H427 330 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0B4J203 849 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 H3BUA1 57 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 TPPPO94811 219 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV12-3P01733 135 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV1-16P04430 117 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 CEACAM6P40199 344 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 LGALS7P47929 136 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R43P59537 309 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 HLA-DRB3P79483 266 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 CDH26Q8IXH8 852 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 BVESQ8NE79 360 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 GGHQ92820 318 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM80Q96HE8 168 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 RNF5Q99942 180 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 NICN1Q9BSH3 213 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF221Q9UK13 617 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.84□□□□□ -1.15
DDX39B-211ENST00000449757 M0R1X1 148 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 MYL12BO14950 172 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 MPPED1O15442 326 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 CSN3P07498 182 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 UBBP0CG47 229 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 AADACP22760 399 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB25P24278 435 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00205P59089 165 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 CBX3Q13185 183 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 PDPNQ86YL7 162 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF383Q8NA42 475 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 CYGBQ8WWM9 190 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 HARBI1Q96MB7 349 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 NEURL2Q9BR09 285 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 PEMTQ9UBM1 199 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 GHRLQ9UBU3 117 aa7.83□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 OR2A4O95047 310 aa7.82□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 CELP19835 753 aa7.82□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 HTR2CP28335 458 aa7.82□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.82□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 DYRK1AQ13627 763 aa7.82□□□□□ -1.16
DDX39B-211ENST00000449757 GUCA2BQ16661 112 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 903 ms