RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PTPA-222	ENST00000445241	FAM25A	B3EWG3	89 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	FAM25C	B3EWG5	89 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	FAM25G	B3EWG6	89 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241		H0YJW9	148 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TUSC2	O75896	110 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R46	P59540	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	PROP1	O75360	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	APOA2	P02652	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	HNF4G	Q14541	408 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	PDPN	Q86YL7	162 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241		Q8N9W7	124 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SNAPC3	Q92966	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	KCNAB3	O43448	404 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	PEX14	O75381	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	IGHG2	P01859	326 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RRAS	P10301	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	THBS3	P49746	956 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CDK10	Q15131	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NPB	Q8NG41	125 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241		M0R1X1	148 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NBR2	O15453	112 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RGS5	O15539	181 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA3	O95167	84 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SPDEF	O95238	335 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	PTHLH	P12272	177 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RCVRN	P35243	200 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ACTB	P60709	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CBX3	Q13185	183 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	MMD	Q15546	238 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ANK2	Q01484	3957 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241		H7C2Y5	167 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	F2RL1	P55085	397 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZS46	218 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PTPA-222	ENST00000445241	CTDSP2	O14595	271 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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