RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 TRDCB7Z8K6 153 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FCN1O00602 326 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FABP7O15540 132 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 IGHG4P01861 327 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ELANEP08246 267 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 MYCNOSP40205 109 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ZNF383Q8NA42 475 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CLCC1Q96S66 551 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GON7Q9BXV9 100 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR51E2Q9H255 320 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 KLK15Q9H2R5 256 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 Q9H521 79 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GNB4Q9HAV0 340 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 STUB1Q9UNE7 303 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GAB2Q9UQC2 676 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 A3GALT2U3KPV4 340 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 SORL1Q92673 2214 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR5H14A6NHG9 310 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 K7EIL1 84 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CCL24O00175 119 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ITGB1BP1O14713 200 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1-16P04430 117 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RAB6AP20340 208 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GADD45AP24522 165 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 PSMB8P28062 276 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 PLGLAQ15195 96 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 LIN54Q6MZP7 749 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RNF152Q8N8N0 203 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 C5orf30Q96GV9 206 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR5B12Q96R08 314 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ATG5Q9H1Y0 275 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR2D2Q9H210 308 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 M0R1X1 148 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RRHO14718 337 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 MXD1Q05195 221 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ARFRP1Q13795 201 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 NEDD8Q15843 81 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ZNF773Q6PK81 442 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR4A4PQ8NGN8 299 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR8U1Q8NH10 309 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 PTX4Q96A99 478 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CABLES2Q9BTV7 478 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ZNF221Q9UK13 617 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PN81 502 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 NOTOA8MTQ0 251 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 J3QRK9 145 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 SOX15O60248 233 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 TFAP2AP05549 437 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR8U9P0C7N5 309 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR5H8P0DN80 308 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GALP22466 123 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 SLC6A1P30531 599 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CHRNA7P36544 502 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 LUMP51884 338 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CX3CL1P78423 397 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FCGR1BQ92637 280 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ZNF580Q9UK33 172 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 SSR3Q9UNL2 185 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 COL7A1Q02388 2944 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 TMEM235A6NFC5 223 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A17O43808 307 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 CA2P00918 260 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 IGLV1-40P01703 118 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 MC5RP33032 325 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 SDC2P34741 201 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAME-209ENST00000439106 GNB1P62873 340 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms