RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 ZNF880Q6PDB4 577 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 CRYBA1P05813 215 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 TCL1AP56279 114 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 TOMM20LQ6UXN7 152 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 WDR81Q562E7 1941 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 GLIPR1P48060 266 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 POC1AQ8NBT0 407 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 SMDT1Q9H4I9 107 aa17.74■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 A0A0B4J293 547 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 NAT2P11245 290 aa17.73■□□□□ 0.43
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NISCH-201ENST00000345716 WDR73Q6P4I2 378 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa17.73■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa17.73■□□□□ 0.43
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NISCH-201ENST00000345716 POM121Q96HA1 1249 aa17.72■□□□□ 0.43
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NISCH-201ENST00000345716 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa17.72■□□□□ 0.43
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NISCH-201ENST00000345716 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 DOLPP1Q86YN1 238 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 CALHM1Q8IU99 346 aa17.72■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
NISCH-201ENST00000345716 NRN1LQ496H8 165 aa17.71■□□□□ 0.43
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NISCH-201ENST00000345716 FAM122AQ96E09 287 aa17.71■□□□□ 0.43
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NISCH-201ENST00000345716 ZNF596Q8TC21 504 aa17.71■□□□□ 0.43
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NISCH-201ENST00000345716 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa17.71■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa17.7■□□□□ 0.42
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NISCH-201ENST00000345716 HTR1DP28221 377 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
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NISCH-201ENST00000345716 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 SMIM17P0DL12 118 aa17.7■□□□□ 0.42
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NISCH-201ENST00000345716 C9orf172C9J069 976 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 FAM90A26D6RGX4 464 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 ERVFRD-1P60508 538 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 PGA5P0DJD9 388 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 STXBP6Q8NFX7 210 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 PCGF1Q9BSM1 259 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 LPAR2Q9HBW0 351 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 ICE1Q9Y2F5 2266 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 SMPD2O60906 423 aa17.69■□□□□ 0.42
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NISCH-201ENST00000345716 LHFPL5Q8TAF8 219 aa17.69■□□□□ 0.42
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NISCH-201ENST00000345716 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 S1PR2O95136 353 aa17.69■□□□□ 0.42
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NISCH-201ENST00000345716 TMEM204Q9BSN7 226 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 PARD6AQ9NPB6 346 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 SPTBN2O15020 2390 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 MEOX2P50222 304 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 TNFRSF9Q07011 255 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 LEAP2Q969E1 77 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 MARCH11A6NNE9 402 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-201ENST00000345716 RHBDL1O75783 438 aa17.68■□□□□ 0.42
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