RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 RPRMQ9NS64 109 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 ADAMTS20P59510 1910 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 AMBPP02760 352 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 RAB4AP20338 218 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 ARR3P36575 388 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 AESQ08117 197 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 SDSLQ96GA7 329 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 POM121L2Q96KW2 1035 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 DECR2Q9NUI1 292 aa16.85■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 OR4A8P0C604 315 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 GZMBP10144 247 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 OR5A2Q8NGI9 324 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 TRIB1Q96RU8 372 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 OR2H2O95918 312 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM11P17152 192 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 EGR1P18146 543 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 G6PCP35575 357 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 CLDND2Q8NHS1 167 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 DUSP13Q9UII6 198 aa16.84■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 WISP2O76076 250 aa16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 UCP3P55916 312 aa16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 ASCL4Q6XD76 172 aa16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 YPEL4Q96NS1 127 aa16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 VPS25Q9BRG1 176 aa16.83■□□□□ 0.29
SPNS2-201ENST00000329078 A8MWP6 167 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 B4E171 279 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 DLEU1O43261 78 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 HOXC12P31275 282 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TSPAN7P41732 249 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR5P3Q8WZ94 311 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 NINJ1Q92982 152 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SLC25A22Q9H936 323 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PITX3O75364 302 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 NAPSAO96009 420 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR1L1Q8NH94 360 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR2D2Q9H210 308 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ARV1Q9H2C2 271 aa16.83■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SYNGR2O43760 224 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 CD46P15529 392 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 CHRNA7P36544 502 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 LRTM2Q8N967 370 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 IL36GQ9NZH8 169 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 CLN8Q9UBY8 286 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 C16orf82Q7Z2V1 217 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SCCPDHQ8NBX0 429 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ATP5SQ99766 215 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PPP5D1E7EU14 171 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SP1P08047 785 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TECTBQ96PL2 329 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 RBKSQ9H477 322 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 KCNIP1Q9NZI2 227 aa16.82■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 CTXN2P0C2S0 81 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 UCP1P25874 307 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 RNFT1Q5M7Z0 435 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 DCTN5Q9BTE1 182 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1CBP62140 327 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 HES3Q5TGS1 186 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ABHD14BQ96IU4 210 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 RTL8AQ9BWD3 113 aa16.81■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 DFFBO76075 338 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 ARL16Q0P5N6 197 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PCSK4Q6UW60 755 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 GATAD1Q8WUU5 269 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM56Q96MV1 263 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SLC39A9Q9NUM3 307 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 PPIAL4AQ9Y536 164 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 IL18BPO95998 194 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 RAC2P15153 192 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 NMSQ5H8A3 153 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 DBX2Q6ZNG2 339 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 SSX7Q7RTT5 188 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 LHX4Q969G2 390 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 RAMP3O60896 148 aa16.8■□□□□ 0.28
SPNS2-201ENST00000329078 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms