RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 CHIAQ9BZP6 476 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 PDZD2O15018 2839 aa14.54□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.53□□□□□ -0.08
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IMP4-201ENST00000259239 RNF212BA8MTL3 300 aa14.53□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 J3QR06 171 aa14.53□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 M0R1X1 148 aa14.53□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 RAB29O14966 203 aa14.53□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 ADAP1O75689 374 aa14.53□□□□□ -0.08
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IMP4-201ENST00000259239 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.53□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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IMP4-201ENST00000259239 LINC00311Q8N616 119 aa14.52□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.52□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.52□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 ZNF596Q8TC21 504 aa14.52□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.52□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
IMP4-201ENST00000259239 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
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IMP4-201ENST00000259239 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 CATR1Q13166 79 aa14.52□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.52□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 B3GALNT1O75752 331 aa14.5□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 CDS2O95674 445 aa14.5□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 SERPINE2P07093 398 aa14.5□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 SLC35G3Q8N808 338 aa14.5□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.49□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 C5orf51A6NDU8 294 aa14.49□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.49□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.49□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.49□□□□□ -0.09
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IMP4-201ENST00000259239 TNFRSF14Q92956 283 aa14.49□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
IMP4-201ENST00000259239 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.49□□□□□ -0.09
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