RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	VEGFC	P49767	419 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PPP3R1	P63098	170 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	NDP	Q00604	133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RAB40B	Q12829	278 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GPR176	Q14439	515 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LINC01619	G3V211	115 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		G3V318	75 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	EI24	O14681	340 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	HSPA12A	O43301	675 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	HBZ	P02008	142 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GLA	P06280	429 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	BDKRB2	P30411	391 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RAB9A	P51151	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF134	P52741	427 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SLURP1	P55000	103 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ACTB	P60709	375 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	HTD2	P86397	168 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PITPNA	Q00169	270 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RIPK1	Q13546	671 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	NPB	Q8NG41	125 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		Q96MT0	163 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	S100A13	Q99584	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		A0A087WW49	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		A0A1W2PN81	502 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939		A0A1W2PP11	408 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SOX15	O60248	233 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GPX5	O75715	221 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RGS11	O94810	467 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	PI3	P19957	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CNTFR	P26992	372 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	CHRNA7	P36544	502 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SOX2	P48431	317 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	RASSF2	P50749	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	GNMT	Q14749	295 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PDE4D-229	ENST00000638939	MORN2	Q502X0	79 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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