RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ST8SIA5O15466 376 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SC5DO75845 299 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMS3P0CW19 117 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMS4P0CW20 117 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MGMTP16455 207 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH3A2P51648 485 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1F10Q8WWZ1 152 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI27L2Q9H2X8 130 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A7PA6NKC0 464 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TFAP2AP05549 437 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL39P5Q59GN2 51 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM71F2Q6NXP2 309 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PIPOXQ9P0Z9 390 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ABRACLQ9P1F3 81 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5H14A6NHG9 310 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 BAG2O95816 211 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CA2P00918 260 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 GLAP06280 429 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2G6Q5TZ20 316 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OR9G4Q8NGQ1 327 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM19Q96E16 107 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB29O14966 203 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD6O75340 191 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CIB2O75838 187 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CT45A6P0DMU7 189 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CT45A5P0DMU8 189 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CT45A7P0DMV0 189 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNJ2BPP57105 145 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LCN12Q6JVE5 192 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 WASHC3Q9Y3C0 194 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ALMS1Q8TCU4 4167 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YJW9 148 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RBBP9O75884 186 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MC5RP33032 325 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ETV1P50549 477 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LY6G6FQ5SQ64 297 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF562Q6V9R5 426 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CBR4Q8N4T8 237 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 POC5Q8NA72 575 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM46BQ96A09 425 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 Q96M66 194 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC42Q9Y546 428 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPK0 400 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 Q499Y3 187 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 GHSRQ92847 366 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JLM5 398 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A1O15245 554 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 GPX5O75715 221 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF2P50749 326 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG5Q15238 335 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGN3Q15651 99 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N402 240 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5T1Q8NG75 326 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHA3Q9HB20 300 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 OGG1O15527 345 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 FSTP19883 344 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SETD6Q8TBK2 473 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD14BQ96IU4 210 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 HIPK2Q9H2X6 1198 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 BABAM2Q9NXR7 383 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SHISA3A0PJX4 238 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CPEP16870 476 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 FXYD3Q14802 87 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TATDN3Q17R31 274 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MOGAT2Q3SYC2 334 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS16P62249 146 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFA5Q01523 94 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 IL34Q6ZMJ4 242 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 OR14A2Q96R54 314 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF5Q99942 180 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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