RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 Q8N2B8 174 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 GINS4Q9BRT9 223 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ABCG5Q9H222 651 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 RDH8Q9NYR8 311 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 MOSP00540 346 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 GSTT2P0CG29 244 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 GSTT2BP0CG30 244 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 CD1BP29016 333 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 GPR12P47775 334 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 BLCAPP62952 87 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 HNF4GQ14541 408 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 IGSF11Q5DX21 431 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZS49 121 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 S1PR3Q99500 378 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SCOCQ9UIL1 159 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ZNF221Q9UK13 617 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 FGF16O43320 207 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 XRCC3O43542 346 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SSX5O60225 188 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 TAS2R20P59543 309 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ARPC4P59998 168 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 EBI3Q14213 229 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 MZT2AQ6P582 158 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 NABP2Q9BQ15 211 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 OR2D2Q9H210 308 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 GHITMQ9H3K2 345 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 IFT46Q9NQC8 304 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 OR5H14A6NHG9 310 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 HPGDSO60760 199 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 APOA1P02647 267 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 AMY1AP04745 511 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 AMY2AP04746 511 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 CTXN2P0C2S0 81 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 OR8U9P0C7N5 309 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 PTHLHP12272 177 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SOX6P35712 828 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 CBX5P45973 191 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 TMBIM6P55061 237 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SPCS2Q15005 226 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 MMDQ15546 238 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 CNIH2Q6PI25 160 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 Q6ZS46 218 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 Q8N6K4 173 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 BEST4Q8NFU0 473 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 OR8U1Q8NH10 309 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 CMTM3Q96MX0 182 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 CITED1Q99966 193 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 AGMATQ9BSE5 352 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 RNF150Q9ULK6 438 aa7.34□□□□□ -1.23
NELFE-214ENST00000625905 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-214ENST00000625905 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-214ENST00000625905 FAM25AB3EWG3 89 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-214ENST00000625905 FAM25CB3EWG5 89 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms