RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf170-201ENST00000623052 USF3Q68DE3 2245 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf170-201ENST00000623052 FABP1P07148 127 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CD55P08174 381 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RAB11AP62491 216 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HES3Q5TGS1 186 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OR52L2PQ8NGH6 319 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 COQ2Q96H96 371 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 NIT2Q9NQR4 276 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TINAGQ9UJW2 476 aa11.21□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 IFNA17P01571 189 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CD200P41217 278 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00205P59089 165 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 BEND4Q6ZU67 534 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 METRNQ9UJH8 293 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 KNTC1P50748 2209 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 J3QW42 95 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 G6PCP35575 357 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OR3A1P47881 315 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RAB2AP61019 212 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GUSBP1Q15486 140 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB123Q8N688 67 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OR2D2Q9H210 308 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 LAMA5O15230 3695 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SH2D1BO14796 132 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CD46P15529 392 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HOXA5P20719 270 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TNFRSF9Q07011 255 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HNF4GQ14541 408 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ACSM6Q6P461 480 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 PHOX2AO14813 284 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BKO60814 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 S1PR2O95136 353 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BJP06899 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RAC2P15153 192 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BOP23527 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BBP33778 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BDP58876 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BCP62807 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 AESQ08117 197 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GABRA6Q16445 453 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 LILRB2Q8N423 598 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 AGFG2O95081 481 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CDH20Q9HBT6 801 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 SIRT7Q9NRC8 400 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 DOK5Q9P104 306 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CXorf65A6NEN9 183 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf98A8MV24 154 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 TLE1Q04724 770 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CLN8Q9UBY8 286 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ODAMA1E959 279 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CYB5BO43169 146 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HBZP02008 142 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 CD81P60033 236 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 MIOXQ9UGB7 285 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 KRASP01116 189 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HBG1P69891 147 aa11.18□□□□□ -0.62
C9orf170-201ENST00000623052 HBG2P69892 147 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms