RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590619.1

DNMT1-222, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 1 (best)

Gene DNMT1, Length 231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-222	ENST00000590619	MC5R	P33032	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	MED21	Q13503	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF124	Q15973	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619		A0A0G2JND7	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619		H3BN98	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	AIP	O00170	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	GMNN	O75496	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	RBBP9	O75884	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	HTR3B	O95264	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	HMGN1	P05114	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	RHOG	P84095	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	CDK5	Q00535	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	RIPK1	Q13546	671 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM187	Q14656	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	GNMT	Q14749	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	KISS1	Q15726	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	RNF212	Q495C1	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619		H3BNX3	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619		H7C2Y5	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	TSPAN4	O14817	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SULT1B1	O43704	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SNX3	O60493	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	YPEL1	O60688	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	PROP1	O75360	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	CRYGB	P07316	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OCM2	P0CE71	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ZNF20	P17024	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	CRISP1	P54107	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	MED22	Q15528	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DNMT1-222	ENST00000590619	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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