RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 MMP26Q9NRE1 261 aa15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 K7N7A8 449 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SEC11BP0C7V7 166 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SSTR5P35346 364 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 RAB40CQ96S21 281 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 GCM1Q9NP62 436 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 OR6C3Q9NZP0 311 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 JPT1Q9UK76 154 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 C15orf65H3BRN8 121 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 THBDP07204 575 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 BSPH1Q075Z2 132 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 CR1LQ2VPA4 569 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 C4orf17Q53FE4 359 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 C14orf79Q96F83 325 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.6■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 IGSF23A1L1A6 192 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 DPRXA6NFQ7 191 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 MED6O75586 246 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 IGKV1-39P01597 117 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 IGKV1D-39P04432 117 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 CD55P08174 381 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 TNFRSF1AP19438 455 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 CD80P33681 288 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF585BQ52M93 769 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SPRNQ5BIV9 151 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 TPRX1Q8N7U7 411 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 PARP11Q9NR21 331 aa15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SPNS3-204ENST00000575194 A0A0G2JRQ6 117 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 LGALS8O00214 317 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 FBXO24O75426 580 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 NHLH2Q02577 135 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 SDSLQ96GA7 329 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 WFDC1Q9HC57 220 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 COA4Q9NYJ1 87 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 CACNG5Q9UF02 275 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 RNF150Q9ULK6 438 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 LRRC30A6NM36 301 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 FAM90A26D6RGX4 464 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 CHST1O43916 411 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 IGKV1-5P01602 117 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 OR4A8P0C604 315 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 LPAR6P43657 344 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 ASCL1P50553 236 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 RAB5CP51148 216 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 ADIPOQQ15848 244 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 STUMQ69YW2 141 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 STX12Q86Y82 276 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 MMP24Q9Y5R2 645 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 SPP1P10451 314 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 CHRNB4P30926 498 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 NARFLQ9H6Q4 476 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 GNG12Q9UBI6 72 aa15.57■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 F2RL2O00254 374 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 YPEL1O60688 119 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 F2RL1P55085 397 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 EDDM3BP56851 147 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 YPEL2Q96QA6 119 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 EGLN1Q9GZT9 426 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 PSG11Q9UQ72 335 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.56■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 NKX6-3A6NJ46 265 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 C17orf100A8MU93 164 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 CLDN1O95832 211 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 M6PRP20645 277 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 MST1LQ2TV78 715 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 TEX36Q5VZQ5 186 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 ZNRF1Q8ND25 227 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS3-204ENST00000575194 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms