RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 DAOP14920 347 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 S100A11P31949 105 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TLE4Q04727 773 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCUN1D4Q92564 292 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 YPEL2Q96QA6 119 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARL6Q9H0F7 186 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNAPC5O75971 98 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SERPINE2P07093 398 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFYBP25208 207 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF273Q14593 569 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB9BQ9NP90 201 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.71□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 C4BPBP20851 252 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDKN1AP38936 164 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF134P52741 427 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q3ZCU0 254 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 AVPI1Q5T686 147 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR1S1Q8NH92 325 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGMATQ9BSE5 352 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MMP23AO75900 390 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNT2P09544 360 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVFRD-1P60508 538 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PPE3 182 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF222A6NCQ9 220 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF212BA8MTL3 300 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OVOL3O00110 214 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC31A2O15432 143 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 B3GALNT1O75752 331 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPR12P47775 334 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF585BQ52M93 769 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL22RA2Q969J5 263 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHODLQ9H9P2 273 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV1-39P01597 117 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV1D-39P04432 117 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL3L1P16619 93 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00205P59089 165 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB1CQ92928 201 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TIMD4Q96H15 378 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.68□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0D9SG52 128 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2F2O95006 317 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLDN1O95832 211 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 PET100P0DJ07 73 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LYL1P12980 280 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 VDAC1P21796 283 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM33P57088 247 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2F1Q13607 317 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MSMO1Q15800 293 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEX261Q6UWH6 196 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 U3KQ87 197 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL12A1Q99715 3063 aa14.67□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 USF3Q68DE3 2245 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0G2JRQ6 117 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPHA1P21709 976 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 LPAR6P43657 344 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 EFNA4P52798 201 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CATR1Q13166 79 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 NMSQ5H8A3 153 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.66□□□□□ -0.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms