RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 STUB1Q9UNE7 303 aa6.4□□□□□ -1.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.4□□□□□ -1.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ODAMA1E959 279 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV1D-33P01593 117 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV1-33P01594 117 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8U8P0C7N1 319 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSD17B1P14061 328 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 GABRR1P24046 479 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTGFRP43088 359 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDC42P60953 191 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSME3P61289 254 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2V2Q15819 145 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8IYB0 196 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8H3Q8N146 312 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8N9W7 124 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR11H1Q8NG94 326 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR9G1Q8NH87 305 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPEQ96AT9 228 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHST5Q9GZS9 411 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNB4Q9HAV0 340 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF150Q9ULK6 438 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 COPS3Q9UNS2 423 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.39□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC182A6NF36 153 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 A6NIN4 97 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNFRSF11BO00300 401 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF254O75437 659 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCNB2O95067 398 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGF1P05019 195 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 CGB3P0DN86 165 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 CGB7P0DN87 165 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPBWR2P48146 333 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF616Q08AN1 781 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYPD6Q86Y78 171 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM104Q8NE00 496 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 FEVQ99581 238 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 MROQ9BYG7 248 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2H2O95918 312 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCL3P20749 454 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP6V1B2P21281 511 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB7AP51149 207 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALDH3A2P51648 485 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP5CP53041 499 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 HCCSP53701 268 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAX5Q02548 391 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 AESQ08117 197 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 MADCAM1Q13477 382 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 HES1Q14469 280 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 MICAQ29983 383 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 MMD2Q8IY49 270 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 GON7Q9BXV9 100 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 R4GMQ9 66 aa6.37□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIRPB1O00241 398 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOR1AO14656 332 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 OVOL1O14753 267 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSD17B6O14756 317 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIR3DL2P43630 455 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms