RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RAB40BQ12829 278 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 AWAT2Q6E213 333 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 TRAT1Q6PIZ9 186 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 GAPTQ8N292 157 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 OR2AK2Q8NG84 335 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 IL1F10Q8WWZ1 152 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 FAM46BQ96A09 425 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 YPEL1O60688 119 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 LALBAP00709 142 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 MGMTP16455 207 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 FUT3P21217 361 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SYNJ2BPP57105 145 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 LINC00205P59089 165 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 GPR176Q14439 515 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 RHOXF1Q8NHV9 184 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 GRPEL2Q8TAA5 225 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 ABHD14BQ96IU4 210 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 YPEL2Q96QA6 119 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-227ENST00000551441 SC5DO75845 299 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 ALDH3A2P51648 485 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CBR4Q8N4T8 237 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 APH1BQ8WW43 257 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 RNF150Q9ULK6 438 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 RGS11O94810 467 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 TRBV12-3P01733 135 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CD40LGP29965 261 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 HTD2P86397 168 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 PSG5Q15238 335 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 AKIRIN2Q53H80 203 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 SETD6Q8TBK2 473 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 GHSRQ92847 366 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 GALMQ96C23 342 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 Q96M66 194 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 Q96MT0 163 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 SULT4A1Q9BR01 284 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 HIPK2Q9H2X6 1198 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 H0YJW9 148 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 OGG1O15527 345 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 PDCD6O75340 191 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 BRI3O95415 125 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 DYRK1AQ13627 763 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CCDC58Q4VC31 144 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 SMIM19Q96E16 107 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 OR14A2Q96R54 314 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 FAAP24Q9BTP7 215 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 SLA2Q9H6Q3 261 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CKLFQ9UBR5 152 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CEPT1Q9Y6K0 416 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 H0Y980 276 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CA11O75493 328 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 TFAP2AP05549 437 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CSN3P07498 182 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 APELAP0DMC3 54 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 ZP3P21754 424 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 FXYD3Q14802 87 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 HMGN3Q15651 99 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 OR10K2Q6IF99 312 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 POC5Q8NA72 575 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 BABAM2Q9NXR7 383 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 PIPOXQ9P0Z9 390 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 STEAP1Q9UHE8 339 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 WASHC3Q9Y3C0 194 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 RAB29O14966 203 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 GPX5O75715 221 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CIB2O75838 187 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 CD81P60033 236 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 RPS16P62249 146 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-227ENST00000551441 Q499Y3 187 aa12.23□□□□□ -0.45
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