RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 ZNF329Q86UD4 541 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 NABP2Q9BQ15 211 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 AGMATQ9BSE5 352 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 KCNK15Q9H427 330 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 LINC01548A6NM66 108 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 THBS3P49746 956 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 F2RL1P55085 397 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 TEX38Q6PEX7 206 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 PTX4Q96A99 478 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 Q9N2K0 584 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 AK3Q9UIJ7 227 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 RAB22AQ9UL26 194 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 PDCD5O14737 125 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 RAB29O14966 203 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 ELANEP08246 267 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 ZBTB25P24278 435 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 SOX6P35712 828 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 VEGFCP49767 419 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 CFHR3Q02985 330 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 FOXE3Q13461 319 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 NPBQ8NG41 125 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 PECRQ9BY49 303 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-221ENST00000550734 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 SHISA3A0PJX4 238 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 IFITM5A6NNB3 132 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 NDUFA3O95167 84 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 DIRAS3O95661 229 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 IGHG4P01861 327 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 HLA-DRB1P01911 266 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 RAB6AP20340 208 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 MYCNOSP40205 109 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 OR3A3P47888 321 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CLDN12P56749 244 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 ACTBP60709 375 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 HLA-DRB3P79483 266 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 DGCR2P98153 550 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 SPARTQ8N0X7 666 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 FCGR1BQ92637 280 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 P2RX4Q99571 388 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 RNF5Q99942 180 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 Q9H521 79 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 OR5H14A6NHG9 310 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 RAB27BO00194 218 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 RAMP3O60896 148 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 PROP1O75360 226 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CT45A6P0DMU7 189 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CT45A5P0DMU8 189 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CT45A7P0DMV0 189 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 OR5H8P0DN80 308 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 RAB3BP20337 219 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 MC5RP33032 325 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 CEACAM6P40199 344 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 SERPINB10P48595 397 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 MMDQ15546 238 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 ZNF695Q8IW36 515 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 RITA1Q96K30 269 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 GAB2Q9UQC2 676 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9□□□□□ -0.97
CS-221ENST00000550734 TRDCB7Z8K6 153 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms