RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ANGPTL7O43827 346 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 LYZL6O75951 148 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CST4P01036 141 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 NGFP01138 241 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CRYGCP07315 174 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CXCL1P09341 107 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 OR4A8P0C604 315 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PGAM2P15259 253 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 COX5AP20674 150 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 BMP5P22003 454 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 LMO1P25800 156 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MC5RP33032 325 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 GLIPR1P48060 266 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ARL6IP1Q15041 203 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PET117Q6UWS5 81 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 OR8G5Q8NG78 346 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MOB3AQ96BX8 217 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 SLC6A7Q99884 636 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PECRQ9BY49 303 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 RBKSQ9H477 322 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 POFUT1Q9H488 388 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 IL36GQ9NZH8 169 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MEMO1Q9Y316 297 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ATRXP46100 2492 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 SLC25A17O43808 307 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 IL2RAP01589 272 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 IGKV1D-12P01611 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ZBTB25P24278 435 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 HRH1P35367 487 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ERVFRD-1P60508 538 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 RHOGP84095 191 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 FOXF2Q12947 444 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ARFRP1Q13795 201 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 GABRA6Q16445 453 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PRSS8Q16651 343 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 RTL6Q6ICC9 239 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 Q6ZRG5 221 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PLK3Q9H4B4 646 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CST9LQ9H4G1 147 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 DKK4Q9UBT3 224 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 COX11Q9Y6N1 276 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 FRYQ5TBA9 3013 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 DOCK7Q96N67 2140 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PR80 420 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CD300LBA8K4G0 201 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CSN2P05814 226 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CELA3BP08861 270 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PET100P0DJ07 73 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 GLRA1P23415 457 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PTGER4P35408 488 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 UBE2KP61086 200 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 FBLN7Q53RD9 439 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 BEX5Q5H9J7 111 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 HOGA1Q86XE5 327 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 OSR2Q8N2R0 312 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ZNF611Q8N823 705 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 MITD1Q8WV92 249 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 TOMM40LQ969M1 308 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CYYR1Q96J86 154 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 SNX22Q96L94 193 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 IMMP2LQ96T52 175 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-204ENST00000546621 HSF4Q9ULV5 492 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms