RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF429	Q86V71	674 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	THRSP	Q92748	146 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SORL1	Q92673	2214 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	C3orf84	H3BNL1	204 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	UBB	P0CG47	229 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	GABARAPL2	P60520	117 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	HMGN3	Q15651	99 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ECSCR	Q19T08	205 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	OR10K2	Q6IF99	312 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1W2PN81	502 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ST8SIA5	O15466	376 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SAP30	O75446	220 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CHRNA7	P36544	502 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	NDP	Q00604	133 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	MED22	Q15528	200 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SPART	Q8N0X7	666 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	MND1	Q9BWT6	205 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FBXL15	Q9H469	300 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01619	G3V211	115 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	RRH	O14718	337 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	RAB29	O14966	203 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SOX15	O60248	233 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CT45A6	P0DMU7	189 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CT45A5	P0DMU8	189 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CT45A7	P0DMV0	189 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SLURP1	P55000	103 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CX3CL1	P78423	397 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	INSL4	Q14641	139 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	PLGLA	Q15195	96 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SPHAR	Q15513	63 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	FCN1	O00602	326 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SPN	P16150	400 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	HTR2C	P28335	458 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF773	Q6PK81	442 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SVOP	Q8N4V2	548 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SETD6	Q8TBK2	473 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	TM2D1	Q9BX74	207 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	GHITM	Q9H3K2	345 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	OR5H14	A6NHG9	310 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	NAPSA	O96009	420 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	MC5R	P33032	325 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	NICN1	Q9BSH3	213 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	KCNK15	Q9H427	330 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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