RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
DDB1-208	ENST00000537120	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
DDB1-208	ENST00000537120	PARP11	Q9NR21	331 aa		6.59	□□□□□ -1.35
DDB1-208	ENST00000537120	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
DDB1-208	ENST00000537120	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		6.59	□□□□□ -1.35
DDB1-208	ENST00000537120	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		6.59	□□□□□ -1.35
DDB1-208	ENST00000537120	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
DDB1-208	ENST00000537120	RAB29	O14966	203 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PSMD7	P51665	324 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	DEFB136	Q30KP8	78 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	LYPD6	Q86Y78	171 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR5B12	Q96R08	314 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	NABP2	Q9BQ15	211 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	NICN1	Q9BSH3	213 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	KCNK15	Q9H427	330 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF221	Q9UK13	617 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RNF150	Q9ULK6	438 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		6.58	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SLC22A1	O15245	554 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	NBR2	O15453	112 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SOCS1	O15524	211 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RAMP3	O60896	148 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	IGHG4	P01861	327 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	UCHL1	P09936	223 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZBTB25	P24278	435 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CNTFR	P26992	372 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CD40LG	P29965	261 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MC5R	P33032	325 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ECI1	P42126	302 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	VEGFC	P49767	419 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	AQP4	P55087	323 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TPBG	Q13641	420 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HMGN3	Q15651	99 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR11H1	Q8NG94	326 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RITA1	Q96K30	269 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	P2RX4	Q99571	388 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TM2D1	Q9BX74	207 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR51J1	Q9H342	316 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	GHITM	Q9H3K2	345 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	AK3	Q9UIJ7	227 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PRELID1	Q9Y255	219 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	VSIG4	Q9Y279	399 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120		G3V318	75 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	PDCD5	O14737	125 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ATP6V0E1	O15342	81 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	LY86	O95711	162 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	IGF1	P05019	195 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CD3G	P09693	182 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CPE	P16870	476 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	MAP2K4	P45985	399 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	CLDN12	P56749	244 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	UNC119	Q13432	240 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	IRF3	Q14653	427 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ECSCR	Q19T08	205 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SMUG1	Q53HV7	270 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	HES5	Q5TA89	166 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	SVOP	Q8N4V2	548 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		6.56	□□□□□ -1.36
DDB1-208	ENST00000537120	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		6.56	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms