RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530036.1

RPUSD4-204, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, human

TSL 3

Gene RPUSD4, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD4-204	ENST00000530036	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HKR1	P10072	659 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZBTB25	P24278	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IL3RA	P26951	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CD40LG	P29965	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ETV6	P41212	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CBX5	P45973	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RPE	Q96AT9	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	BET1	O15155	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ST8SIA5	O15466	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PROP1	O75360	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TUSC2	O75896	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	NDUFA7	O95182	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LPL	P06858	475 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	NAT1	P18440	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	BRS3	P32247	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PRSS3	P35030	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CEACAM6	P40199	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR3A3	P47888	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	REG1B	P48304	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RAB13	P51153	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RELB	Q01201	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	EBI3	Q14213	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LY6E	Q16553	131 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036		Q8N402	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	VWF	P04275	2813 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SULT1C2	O00338	296 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RAB29	O14966	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RBBP9	O75884	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	TSPAN9	O75954	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR2F2	O95006	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CD24	P25063	80 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	CD1B	P29016	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RAG2	P55895	527 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DEFA1	P59665	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	DEFA3	P59666	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	ACTG1	P63261	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPUSD4-204	ENST00000530036	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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