RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506401.6

ITGA3-207, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 1,817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-207ENST00000506401 F2RP25116 425 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF134P52741 427 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SRPXP78539 464 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 TP53RKQ96S44 253 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GPHA2Q96T91 129 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 CHIAQ9BZP6 476 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 RAB18Q9NP72 206 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 TACC2O95359 2948 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PPE2 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PR64 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PRV1 198 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 C17orf98A8MV24 154 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 OR2A4O95047 310 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SIX6O95475 246 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 DSCR9P59020 149 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 Q3ZCU0 254 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LGI3Q8N145 548 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ASB13Q8WXK3 278 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 OR2A7Q96R45 310 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 H0Y980 276 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ERVFRD-1P60508 538 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 RAP2BP61225 183 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 OR51H1Q8NH63 302 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GAB2Q9UQC2 676 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 C5orf51A6NDU8 294 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 FAM25EA8MYX2 175 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 RBP4P02753 201 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GNG10P50151 68 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 H2BFSP57053 126 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 ZFP69Q49AA0 526 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 LRTM2Q8N967 370 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA3-207ENST00000506401 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1W2PPE3 182 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C22orf46C9J442 243 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CCSO14618 274 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 RAB29O14966 203 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SLC31A2O15432 143 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 IFNA21P01568 189 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 HOXB5P09067 269 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 LMO4P61968 165 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CATR1Q13166 79 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 UTF1Q5T230 341 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ADAP1O75689 374 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 SERPINE2P07093 398 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 UCP1P25874 307 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 KRTAP10-9P60411 292 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF695Q8IW36 515 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C5orf30Q96GV9 206 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM56Q96MV1 263 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.64□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CENPEQ02224 2701 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 LYG1Q8N1E2 194 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.63□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 A0A087X0M5 115 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 A0A1B0GX30 115 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 VWC2LB2RUY7 222 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CDS2O95674 445 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 C1QBP02746 253 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 DNASE1P24855 282 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.62□□□□□ -0.07
ITGA3-207ENST00000506401 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms