RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 FA2HQ7L5A8 372 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 LRP11Q86VZ4 500 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 BAGE3Q86Y29 109 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 BAGE2Q86Y30 109 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SULF2Q8IWU5 870 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM123Q8N131 208 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM252Q8N6L7 170 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 NECAP1Q8NC96 275 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 OR10V1Q8NGI7 309 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF480Q8WV37 535 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM171Q8WVE6 324 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 CLDN23Q96B33 292 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SMIM10Q96HG1 83 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SPIN2AQ99865 258 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 DERL1Q9BUN8 251 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 RAB1BQ9H0U4 201 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF665Q9H7R5 613 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF160Q9HCG1 818 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 IL36GQ9NZH8 169 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 JKAMPQ9P055 326 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ERG28Q9UKR5 140 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 HHLA2Q9UM44 414 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 DAPP1Q9UN19 280 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 LAMA1P25391 3075 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 COL4A3Q01955 1670 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 DOCK9Q9BZ29 2069 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 A0A087WV48 116 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 A0A1B0GUS0 222 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 A0A1W2PPV4 95 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 A0A1W2PS18 150 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZFP92A6NM28 416 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SH2D1BO14796 132 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF737O75373 536 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 NUDT3O95989 172 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 CA2P00918 260 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 IGLV1-40P01703 118 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 THBDP07204 575 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SP9P0CG40 484 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 IGLL1P15814 213 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 OMGP23515 440 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 NPY1RP25929 384 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 CRYBB3P26998 211 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ARL3P36405 182 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 PSMB3P49720 205 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 PGFP49763 221 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 GFRA1P56159 465 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF585BQ52M93 769 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 FAM78BQ5VT40 261 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 CDCP2Q5VXM1 449 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TXNDC8Q6A555 127 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 LCN10Q6JVE6 187 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 FIGLAQ6QHK4 219 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF562Q6V9R5 426 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 NUP43Q8NFH3 380 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TSTD1Q8NFU3 115 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 OR8B3Q8NGG8 313 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 OR6K6Q8NGW6 343 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 OR2AE1Q8NHA4 323 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 OTOSQ8NHW6 89 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 C18orf32Q8TCD1 76 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 BORCS7Q96B45 105 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 GALMQ96C23 342 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 OR8B2Q96RD0 313 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 NMNAT3Q96T66 252 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SFXN3Q9BWM7 321 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 NAA60Q9H7X0 242 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 RPRMQ9NS64 109 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 CENPMQ9NSP4 180 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 PRR13Q9NZ81 148 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 RARRES3Q9UL19 164 aa3□□□□□ -1.93
PCAT4-201ENST00000504263 PSG8Q9UQ74 426 aa3□□□□□ -1.93
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