RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 PSG7Q13046 419 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF525Q8N782 197 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 ASB10Q8WXI3 467 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 AHRRA9YTQ3 701 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 PLPP3O14495 311 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 NPIPB7O75200 414 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 ESDP10768 282 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 P2RY2P41231 377 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 NPBWR2P48146 333 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 LCN2P80188 198 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 TGFBR3Q03167 851 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 NMSQ5H8A3 153 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 MUC15Q8N387 334 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 OR4C12Q96R67 309 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.29□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 SERPINE3A8MV23 424 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 MS4A18H0YCH9 400 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 FCN1O00602 326 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 CLDN14O95500 239 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 NUDT3O95989 172 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 IFNA5P01569 189 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 IGFBP7Q16270 282 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 NT5CQ8TCD5 201 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM186Q96B77 213 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 CD207Q9UJ71 328 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 RP1P56715 2156 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 CA2P00918 260 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 Q56UQ5 140 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 GAPTQ8N292 157 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 PATE1Q8WXA2 126 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM12Q96EX1 92 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.28□□□□□ -1.24
VWA3B-220ENST00000495571 SEC16AO15027 2179 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PPIAL4DF5H284 164 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SLC31A1O15431 190 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF253O75346 499 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 AGFG2O95081 481 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 UTS2O95399 124 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CLPSP04118 112 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SLC35E2P0CK97 266 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CEACAM3P40198 252 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PRRX1P54821 245 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NSDHLQ15738 373 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SGCBQ16585 318 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 VWA1Q6PCB0 445 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SNURFLB1AK76 121 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 K7ERU9 68 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ADH5P11766 374 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PSMB3P49720 205 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 CLDN15P56746 228 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 RAET1LQ5VY80 246 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
VWA3B-220ENST00000495571 SFRP2Q96HF1 295 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms