RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488270.1

HDAC10-215, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC10, Length 715 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-215ENST00000488270 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.96□□□□□ -0.01
HDAC10-215ENST00000488270 ABCG5Q9H222 651 aa14.96□□□□□ -0.01
HDAC10-215ENST00000488270 A0A087WXM4 84 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CT45A6P0DMU7 189 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CT45A5P0DMU8 189 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CT45A7P0DMV0 189 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 YIPF6Q96EC8 236 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 SERPINE3A8MV23 424 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 RAB29O14966 203 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 TNFAIP8O95379 198 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CD3GP09693 182 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 GPR12P47775 334 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 MXD1Q05195 221 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CDNFQ49AH0 187 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 IGSF11Q5DX21 431 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 ZNF329Q86UD4 541 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.94□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 A0A075B6Q4 140 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 FABP7O15540 132 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 GSTT2P0CG29 244 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 GSTT2BP0CG30 244 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 TGFBR1P36897 503 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 13.4
HDAC10-215ENST00000488270 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 GHITMQ9H3K2 345 aa14.93□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 PSMB11A5LHX3 300 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 KCNAB3O43448 404 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CNTFRP26992 372 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 ACTBP60709 375 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 Q6ZS49 121 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 R3HDM4Q96D70 268 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 RDH8Q9NYR8 311 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 RNF150Q9ULK6 438 aa14.92□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 A0A1W2PRX2 142 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 HSPA12AO43301 675 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 DIRAS3O95661 229 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 LINC00205P59089 165 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 HACD4Q5VWC8 232 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 STPG2Q8N412 459 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 H0YJW9 148 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 DTYMKP23919 212 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 SERPINB10P48595 397 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 DEFA6Q01524 100 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 KIR2DS1Q14954 304 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 MMDQ15546 238 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 NPBQ8NG41 125 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.9□□□□□ -0.02
HDAC10-215ENST00000488270 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 AP4M1O00189 453 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 BET1O15155 118 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 WIPF1O43516 503 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 SSX5O60225 188 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 SCAND1P57086 179 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 ARFRP1Q13795 201 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 ARL6IP1Q15041 203 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 IDNKQ5T6J7 187 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 PHF21AQ96BD5 680 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 OR4F4Q96R69 305 aa14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 AIREO43918 545 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 NDUFA3O95167 84 aa14.88□□□□□ -0.03
HDAC10-215ENST00000488270 IGF1P05019 195 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms