RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.84□□□□□ -0.03
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLDN14O95500 239 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PMCHL1Q16048 86 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM27BQ5VT28 67 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 F2RL2O00254 374 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIN1P1O15428 100 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.84□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.84□□□□□ -0.03
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