RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 T-ENOLP0DO92 83 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TMEM225BP0DP42 221 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ZNF20P17024 532 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 RIPK1Q13546 671 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ZSCAN26Q16670 478 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 UTS2BQ765I0 119 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 GPHB5Q86YW7 130 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CPOQ8IVL8 374 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TMEM68Q96MH6 324 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.51□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR5H14A6NHG9 310 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 H0YJW9 148 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 H7C2Y5 167 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 AIPO00170 330 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TSPAN4O14817 238 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SULT1B1O43704 296 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 RBBP9O75884 186 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 DBTP11182 482 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CXCR4P61073 352 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 MORN2Q502X0 79 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SETD9Q8NE22 299 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ADI1Q9BV57 179 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.5□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TGOLN2O43493 480 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SPDEFO95238 335 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 MT-ND4P03905 459 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CT45A6P0DMU7 189 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CT45A5P0DMU8 189 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CT45A7P0DMV0 189 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 MED21Q13503 144 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ZNF585BQ52M93 769 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ELP2Q6IA86 826 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ASCL4Q6XD76 172 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 STON2Q8WXE9 905 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 FGGYQ96C11 551 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ASB9Q96DX5 294 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ALG8Q9BVK2 526 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ADGRL4Q9HBW9 690 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 RAB9BQ9NP90 201 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.49□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CCDC182A6NF36 153 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR9G9P0C7N8 305 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 C8orf88P0DMB2 117 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 MIFP14174 115 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 VSNL1P62760 191 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 C15orf32Q32M92 178 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR4A47Q6IF82 309 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TMEM163Q8TC26 289 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 MARC2Q969Z3 335 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 NICN1Q9BSH3 213 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.48□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 OR4C46A6NHA9 309 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TNFRSF11BO00300 401 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CCNB2O95067 398 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 MT-ND2P03891 347 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 IGKV1-16P04430 117 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 FABP3P05413 133 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ARL3P36405 182 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 ACTR3P61158 418 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 NEK7Q8TDX7 302 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 PYURFQ96I23 114 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 PHB2Q99623 299 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 RNF5Q99942 180 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.47□□□□□ -1.05
USP11-208ENST00000480104 H3BN98 237 aa8.46□□□□□ -1.06
USP11-208ENST00000480104 GMNNO75496 209 aa8.46□□□□□ -1.06
USP11-208ENST00000480104 OR2J3O76001 311 aa8.46□□□□□ -1.06
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