RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880		H7C2Y5	167 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RAB29	O14966	203 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SDC2	P34741	201 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	EBI3	Q14213	229 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FABP7	O15540	132 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FCGR3A	P08637	254 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SOX6	P35712	828 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	GPR12	P47775	334 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	F2RL1	P55085	397 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ACTB	P60709	375 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	PLGLA	Q15195	96 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N6K4	173 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N9W7	124 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WXM4	84 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	AP4M1	O00189	453 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	IGHG2	P01859	326 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CD33	P20138	364 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CD83	Q01151	205 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SSR4-208	ENST00000471880	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RAB27B	O00194	218 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	MFNG	O00587	321 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	VDAC1	P21796	283 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	CNTFR	P26992	372 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	STPG2	Q8N412	459 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880		G3V4G9	280 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880		J3QRK9	145 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	NBR2	O15453	112 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINB10	P48595	397 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	GNG2	P59768	71 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	PTX4	Q96A99	478 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RITA1	Q96K30	269 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SSR4-208	ENST00000471880		M0R1X1	148 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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