RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 Q9N2K0 584 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 A0A075B6Q4 140 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 PSMB9P28065 219 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 THBS3P49746 956 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 LY6G6FQ5SQ64 297 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 MRAPQ8TCY5 172 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 MAFIPQ8WZ33 124 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 RNF150Q9ULK6 438 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 HSF4Q9ULV5 492 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 G3V318 75 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 HSPA12AO43301 675 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CD3GP09693 182 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CT45A6P0DMU7 189 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CT45A5P0DMU8 189 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CT45A7P0DMV0 189 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 MYL9P24844 172 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CEACAM6P40199 344 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 LINC00205P59089 165 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 SPARTQ8N0X7 666 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 LRRC42Q9Y546 428 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 WSB1Q9Y6I7 421 aa10.85□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 TNCP24821 2201 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 IFITM5A6NNB3 132 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 PDCD5O14737 125 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 RAB29O14966 203 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V0E1O15342 81 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 NBR2O15453 112 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 GNB3P16520 340 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 RAB3BP20337 219 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 VDAC1P21796 283 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-11P60412 298 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 CFHR3Q02985 330 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 UBE2UQ5VVX9 321 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 TEX38Q6PEX7 206 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 ZNF695Q8IW36 515 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 RAX2Q96IS3 184 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 KCTD7Q96MP8 289 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 AGMATQ9BSE5 352 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 PARP11Q9NR21 331 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 RAB22AQ9UL26 194 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 FBXO7Q9Y3I1 522 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-209ENST00000439106 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 H0YJW9 148 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 PROP1O75360 226 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FCGR3AP08637 254 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ZBTB25P24278 435 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RAB25P57735 213 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 NDPQ00604 133 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 COMMD1Q8N668 190 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR10R2Q8NGX6 335 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RAB3CQ96E17 227 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 P2RX4Q99571 388 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FBXL15Q9H469 300 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ZFP57Q9NU63 452 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 DNAH9Q9NYC9 4486 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 H7C2Y5 167 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RAB27BO00194 218 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 MFNGO00587 321 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 BET1O15155 118 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 NDUFA3O95167 84 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DRB1P01911 266 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 IGF1P05019 195 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GSTT2P0CG29 244 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 GSTT2BP0CG30 244 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 PSMD7P51665 324 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FOXE3Q13461 319 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 ECSCRQ19T08 205 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 IGSF11Q5DX21 431 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 REC114Q7Z4M0 266 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 NPBQ8NG41 125 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 OR51J1Q9H342 316 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RNF167Q9H6Y7 350 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 RDH8Q9NYR8 311 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1456Q9P272 454 aa10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms