RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 G3V318 75 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 I3L521 148 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ATP6V0E1O15342 81 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NBR2O15453 112 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NDUFA3O95167 84 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NAPSAO96009 420 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CD37P11049 281 aa7.32□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PHYHIPQ92561 330 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GALMQ96C23 342 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TM2D1Q9BX74 207 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 KLK15Q9H2R5 256 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR51J1Q9H342 316 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 GNB4Q9HAV0 340 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LRRC42Q9Y546 428 aa7.32□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC22A1O15245 554 aa7.31□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RGS11O94810 467 aa7.31□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 HTR2CP28335 458 aa7.31□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 UNC119Q13432 240 aa7.31□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.31□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.31□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.31□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.31□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.31□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.31□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TMED9Q9BVK6 235 aa7.3□□□□□ -1.24
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCNK15Q9H427 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.3□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 A0A0A6YYD4 124 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR5H14A6NHG9 310 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 H0YJW9 148 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ITGB1BP1O14713 200 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB29O14966 203 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SOX15O60248 233 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UCHL1P09936 223 aa7.29□□□□□ -1.24
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CT45A6P0DMU7 189 aa7.29□□□□□ -1.24
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