RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PAXXQ9BUH6 204 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRSQ13332 1948 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA4P78363 2273 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MPDU1O75352 247 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF735P0CB33 412 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GCSHP23434 173 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CD82P27701 267 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RND1Q92730 232 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PPC1 479 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB29O14966 203 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DQB1P01920 261 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP9P14780 707 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00596Q86U02 117 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SDK2Q58EX2 2172 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ACACAQ13085 2346 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM210A6NLX4 147 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SELENOTP62341 195 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35B1P78383 322 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RELBQ01201 579 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF273Q14593 569 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QL1O75973 258 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 FCGR3AP08637 254 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 COX6CP09669 75 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 APELAP0DMC3 54 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCL2P19875 107 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM27BQ5VT28 67 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SSX8Q7RTT4 187 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PTP4A3O75365 173 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFB4O95168 129 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN14O95500 239 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CA2P00918 260 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC15Q8N387 334 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PPV9 198 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HPRT1P00492 218 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TRGC2P03986 189 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RSG1Q9BU20 258 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 KLK13Q9UKR3 277 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4C46A6NHA9 309 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 A6NJY4 79 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 C21orf140B9A014 251 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CD1AP06126 327 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 NAT2P11245 290 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 LIFP15018 202 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 R4GN57 208 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 MGST3O14880 152 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 KIR3DL2P43630 455 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GZMMP51124 257 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SOSTQ9BQB4 213 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0U1RQV5 110 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 GAGE10A6NGK3 116 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN18P56856 261 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 VWCEQ96DN2 955 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 AGFG2O95081 481 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DQA1P01909 254 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 REG1BP48304 166 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TWIST1Q15672 202 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX30Q5JUR7 227 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-202ENST00000426333 PRNTQ86SH4 94 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms