RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VEGFCP49767 419 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM50BP56557 158 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CLDN12P56749 244 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HLA-DRB3P79483 266 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF152Q8N8N0 203 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 P2RX4Q99571 388 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PECRQ9BY49 303 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GHITMQ9H3K2 345 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC23A1Q9UHI7 598 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF580Q9UK33 172 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB26Q9ULW5 256 aa10.49□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCL24O00175 119 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDCD5O14737 125 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NBR2O15453 112 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSPA12AO43301 675 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DENRO43583 198 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZBTB25P24278 435 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFHR3Q02985 330 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SSX1Q16384 188 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DPF1Q92782 380 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RITA1Q96K30 269 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCTD7Q96MP8 289 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 Q9N2K0 584 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA1456Q9P272 454 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB22AQ9UL26 194 aa10.48□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LDLRAD4O15165 306 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HLA-DRB1P01911 266 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCTP09683 121 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYL9P24844 172 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNTFRP26992 372 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MC5RP33032 325 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CEACAM6P40199 344 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIR2DS1Q14954 304 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HES5Q5TA89 166 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LIN54Q6MZP7 749 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NPBQ8NG41 125 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR8U1Q8NH10 309 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAX2Q96IS3 184 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.47□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR5H14A6NHG9 310 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NDUFA3O95167 84 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP6V1G2O95670 118 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CT45A6P0DMU7 189 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CT45A5P0DMU8 189 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CT45A7P0DMV0 189 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GALP22466 123 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSMB8P28062 276 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB25P57735 213 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KRTAP10-11P60412 298 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GABARAPL2P60520 117 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM65Q6PI78 240 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTX4Q96A99 478 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABHD14BQ96IU4 210 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DUX3Q96PT4 197 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AGMATQ9BSE5 352 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR51J1Q9H342 316 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PARP11Q9NR21 331 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WSB1Q9Y6I7 421 aa10.46□□□□□ -0.73
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IFITM5A6NNB3 132 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRDCB7Z8K6 153 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 H0YJW9 148 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 H7C2Y5 167 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP6V0E1O15342 81 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD3GP09693 182 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB3BP20337 219 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR10A3P58181 314 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLA2G7Q13093 441 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C4orf3Q8WVX3 66 aa10.45□□□□□ -0.74
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAB3CQ96E17 227 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms