RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409627.6

SUMO1-208, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 722 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-208	ENST00000409627	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627		M0QYG6	137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RAB29	O14966	203 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	SSX2	Q16385	188 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RPE	Q96AT9	228 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	HSD17B6	O14756	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RAB3D	O95716	219 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	PPY	P01298	95 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	AADAC	P22760	399 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	CD40LG	P29965	261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	AP3S2	P59780	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	MEF2D	Q14814	521 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	BAK1	Q16611	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TXNL1	O43396	289 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	IFNA6	P05013	189 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	GPR12	P47775	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	PPP5C	P53041	499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TSPAN5	P62079	268 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	AANAT	Q16613	207 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627		Q6YL49	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TMEM17	Q86X19	198 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	MTOR	P42345	2549 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A1W2PPI3	338 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	SLC22A5	O76082	557 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	IL7	P13232	177 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	DYNLT3	P51808	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	HERV-K104	P61576	105 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	LSAMP	Q13449	338 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	S1PR3	Q99500	378 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	AMY2A	P04746	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	PAX6	P26367	422 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	INPP1	P49441	399 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	MSMO1	Q15800	293 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SUMO1-208	ENST00000409627		J3QRK9	145 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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