RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 CLEC1BQ9P126 229 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1W2PPC4 97 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 CBLN1P23435 193 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 TPPP2P59282 170 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 RAET1LQ5VY80 246 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 RNF138Q8WVD3 245 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 OR5P3Q8WZ94 311 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 OR1A1Q9P1Q5 309 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 ATP23Q9Y6H3 246 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 KIR2DS4P43632 304 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 SOX8P57073 446 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 TFF3Q07654 80 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 KIR2DS1Q14954 304 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 ZIC4Q8N9L1 334 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 RNF114Q9Y508 228 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 HS3ST1O14792 307 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 PIAS2O75928 621 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 WNT2P09544 360 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 ATP5G3P48201 142 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 RDH5Q92781 318 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 SGCZQ96LD1 299 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 ELOVL5Q9NYP7 299 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 OR2W1Q9Y3N9 320 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 NDUFB4O95168 129 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 VENTXO95231 258 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 GPM6AP51674 278 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 GNB1P62873 340 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 RPP30P78346 268 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 PSG4Q00888 419 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 PRDX4Q13162 271 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 FBXW9Q5XUX1 488 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 Q6ZS49 121 aa16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PRPF39-201ENST00000355765 MLNRO43193 412 aa16.02■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CCR5P51681 352 aa16.02■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CLDN23Q96B33 292 aa16.02■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 SLC25A6P12236 298 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 NTF4P34130 210 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF709Q8N972 641 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF488Q96MN9 340 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM204Q9BSN7 226 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 TNFSF11O14788 317 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 THBS3P49746 956 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 Q6ZVH6 145 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 SAMD10Q9BYL1 202 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 Q6ZS52 159 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 KRTDAPP60985 99 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 MSMO1Q15800 293 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 STPG4Q8N801 248 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 OR6C6A6NF89 314 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CCNOP22674 350 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 BAGE3Q86Y29 109 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 BAGE2Q86Y30 109 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 SLC35E1Q96K37 410 aa16■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 WDR1O75083 606 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 ZFAND5O76080 213 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 TIAF1O95411 115 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CRISP2P16562 243 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 COMPP49747 757 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF585BQ52M93 769 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CLN8Q9UBY8 286 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 TRAV34A0A0B4J273 112 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 AQP7O14520 342 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CTXN2P0C2S0 81 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 LHX2P50458 406 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CLDN15P56746 228 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 FADS6Q8N9I5 356 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 OR6C1Q96RD1 312 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 CD207Q9UJ71 328 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF39-201ENST00000355765 NDUFB8O95169 186 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms