RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 LSAMPQ13449 338 aa19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 Q8N6K4 173 aa19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 AGMATQ9BSE5 352 aa19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 WNT10AQ9GZT5 417 aa19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 GHITMQ9H3K2 345 aa19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa19.87■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 RAB29O14966 203 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 BET1O15155 118 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 FGF16O43320 207 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 MOSP00540 346 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 DTYMKP23919 212 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF260Q3ZCT1 412 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 IGSF11Q5DX21 431 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 C5orf56Q8N8D9 126 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 S1PR3Q99500 378 aa19.86■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM235A6NFC5 223 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 M0QZ24 198 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 VBP1P61758 197 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 PITPNAQ00169 270 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 FAM71F2Q6NXP2 309 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 Q6ZS49 121 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 SLC25A46Q96AG3 418 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 ABHD14BQ96IU4 210 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 NABP2Q9BQ15 211 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF251Q9BRH9 671 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 CABLES2Q9BTV7 478 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 RDH8Q9NYR8 311 aa19.85■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0A6YYH2 397 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 A6NJ64 397 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 DIRAS3O95661 229 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 GNG2P59768 71 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 RPL39P5Q59GN2 51 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 OR10J5Q8NHC4 309 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 TOLLIPQ9H0E2 274 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 DCSTAMPQ9H295 470 aa19.84■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 TRAV18A0A075B6X5 111 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 OR8H1Q8NGG4 311 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 DIABLOQ9NR28 239 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 PLSCR3Q9NRY6 295 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 RNF150Q9ULK6 438 aa19.83■□□□□ 0.77
CXCL2-201ENST00000296031 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 FBXO24O75426 580 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 TFAP2AP05549 437 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 ABCG5Q9H222 651 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 VWFP04275 2813 aa19.82■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 SSX5O60225 188 aa19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 CD28P10747 220 aa19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 ALDH3B2P48448 385 aa19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 CTF1Q16619 201 aa19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 GPR107Q5VW38 600 aa19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 GINS4Q9BRT9 223 aa19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF221Q9UK13 617 aa19.81■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 GABARAPO95166 117 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 CT45A6P0DMU7 189 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 CT45A5P0DMU8 189 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 CT45A7P0DMV0 189 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 GPR12P47775 334 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 C2orf68Q2NKX9 166 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2NLQ5JXB2 153 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 TREML4Q6UXN2 200 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 GPR141Q7Z602 305 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 SAMD12Q8N8I0 201 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 Q8N9W7 124 aa19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 MGAM2Q2M2H8 2515 aa19.79■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 F2RL1P55085 397 aa19.79■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 FAM131AQ6UXB0 335 aa19.79■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 AUNIPQ9H7T9 357 aa19.79■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 PROP1O75360 226 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 TSPAN15O95858 294 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 OR8U9P0C7N5 309 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 MMDQ15546 238 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 OR5AU1Q8NGC0 362 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 OR8U1Q8NH10 309 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 RITA1Q96K30 269 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 RASL11BQ9BPW5 248 aa19.78■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 WNK1Q9H4A3 2382 aa19.77■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 XRCC3O43542 346 aa19.77■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 IGHG2P01859 326 aa19.77■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 CTXN2P0C2S0 81 aa19.77■□□□□ 0.76
CXCL2-201ENST00000296031 MC5RP33032 325 aa19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms