RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 CENPOQ9BU64 300 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 V9GY05 133 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 A0A0A6YYD4 124 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PPE3 182 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 UBE2QL1A1L167 161 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PDCD5O14737 125 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SLC31A2O15432 143 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-7P01780 117 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 IGF1P05019 195 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RAB6AP20340 208 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 GPR12P47775 334 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 ARL6IP1Q15041 203 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SSX1Q16384 188 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR10K2Q6IF99 312 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 STPG2Q8N412 459 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 CNBD2Q96M20 576 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 S1PR3Q99500 378 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RAB22AQ9UL26 194 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RYR3Q15413 4870 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR5H14A6NHG9 310 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RAB29O14966 203 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR5H8P0DN80 308 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PF4V1P10720 104 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 MYL9P24844 172 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 MAP2K4P45985 399 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 REG1BP48304 166 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SERPINB10P48595 397 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 TMEM50BP56557 158 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 HLA-DRB3P79483 266 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 TEX38Q6PEX7 206 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZPA2 131 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZS49 121 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 LYG1Q8N1E2 194 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RNF5Q99942 180 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 NABP2Q9BQ15 211 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 NICN1Q9BSH3 213 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 Q9N2K0 584 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 IFITM5A6NNB3 132 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SERPINE3A8MV23 424 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 G3V4G9 280 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SOCS1O15524 211 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 TMEM127O75204 238 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RBBP9O75884 186 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 NDUFA3O95167 84 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 HLA-DRB1P01911 266 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 ELANEP08246 267 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 ZBTB25P24278 435 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 MC5RP33032 325 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SOX6P35712 828 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 SCAND1P57086 179 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 CFHR3Q02985 330 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 FOXE3Q13461 319 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 GNMTQ14749 295 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 TPRA1Q86W33 373 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PRR18Q8N4B5 295 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 NPBQ8NG41 125 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 UBALD1Q8TB05 177 aa7.15□□□□□ -1.26
PKP4-218ENST00000629219 PHF21AQ96BD5 680 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms