RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 RHOVQ96L33 236 aa13.12□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 JPT1Q9UK76 154 aa13.12□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 LRRC42Q9Y546 428 aa13.12□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 SOX15O60248 233 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 GLAP06280 429 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 BDKRB2P30411 391 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 SOX2P48431 317 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 TPPP2P59282 170 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 CX3CL1P78423 397 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 LY6G6FQ5SQ64 297 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 LGALS12Q96DT0 336 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 RITA1Q96K30 269 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 TMED9Q9BVK6 235 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 A3GALT2U3KPV4 340 aa13.11□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 RRHO14718 337 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 YPEL1O60688 119 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 HTD2P86397 168 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 LRRC36Q1X8D7 754 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 RAB12Q6IQ22 244 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 GAPTQ8N292 157 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 TMEM106AQ96A25 262 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 YPEL2Q96QA6 119 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 A0A0G2JLM5 398 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 FAM90A7PA6NKC0 464 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 SLC25A17O43808 307 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 RBBP9O75884 186 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 TFAP2AP05549 437 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 MC5RP33032 325 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 TATDN3Q17R31 274 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 LCN12Q6JVE5 192 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 HAPLN4Q86UW8 402 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 Q96MT0 163 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 MS4A10Q96PG2 267 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 RNF5Q99942 180 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 ERVK13-1Q9NX77 482 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 FBXO7Q9Y3I1 522 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 PEX16Q9Y5Y5 336 aa13.09□□□□□ -0.31
STX4-217ENST00000613541 E9PI62 339 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 TRGV3P03979 118 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 NDPQ00604 133 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 CCDC58Q4VC31 144 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 CASTOR1Q8WTX7 329 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 GALMQ96C23 342 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 FBXL15Q9H469 300 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 CKLFQ9UBR5 152 aa13.08□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 SHISA3A0PJX4 238 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 OR5H14A6NHG9 310 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 H3BUA1 57 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 SC5DO75845 299 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 FUT3P21217 361 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 RIPK1Q13546 671 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 ZNF562Q6V9R5 426 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 Q8N402 240 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 OR52L2PQ8NGH6 319 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.07□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 RAB29O14966 203 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 GPX5O75715 221 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 MAS1P04201 325 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 OR3A3P47888 321 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 FAM131AQ6UXB0 335 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 LFNGQ8NES3 379 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 RDH12Q96NR8 316 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 ABRACLQ9P1F3 81 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 CEPT1Q9Y6K0 416 aa13.06□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 A0A1W2PP11 408 aa13.05□□□□□ -0.32
STX4-217ENST00000613541 SLC22A1O15245 554 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms