RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611848.1

SMAD4-217, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 1,648 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-217ENST00000611848 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RNF222A6NCQ9 220 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ADAM20O43506 726 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 OR5H8P0DN80 308 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RRASP10301 218 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PI3P19957 117 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 GATA3P23771 443 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PSMB6P28072 239 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ARPC4P59998 168 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 BAMBIQ13145 260 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MKXQ8IYA7 352 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CLN8Q9UBY8 286 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 JMJD1CQ15652 2540 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 FAM25EA8MYX2 175 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 INAFM1C9JVW0 142 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 TMPRSS2O15393 492 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 BCL2L11O43521 198 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NMBP08949 121 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LYL1P12980 280 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NPBWR2P48146 333 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 P2RX3P56373 397 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 FGF12P61328 243 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ERVK11-1P61568 191 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LCN2P80188 198 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 IL15RAQ13261 267 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 STUMQ69YW2 141 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 Q6ZS49 121 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 Q8IYB0 196 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 THAP6Q8TBB0 222 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 HES4Q9HCC6 221 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RDH8Q9NYR8 311 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.31□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 C5orf51A6NDU8 294 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 J3QLI3 93 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NXPH2O95156 264 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 IFNA2P01563 188 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PSG2P11465 335 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 PGAM2P15259 253 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 BCL3P20749 454 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 HNF1AP20823 631 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 UCP3P55916 312 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MPV17LQ2QL34 196 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CR1LQ2VPA4 569 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 Q6ZPA2 131 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 COMMD7Q86VX2 200 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 TEX29Q8N6K0 151 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF488Q96MN9 340 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CCL13Q99616 98 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 RNF126Q9BV68 326 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CTSZQ9UBR2 303 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 F8VVB4 439 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 F8VWA3 439 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 DVL1O14640 695 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 SIGLEC5O15389 551 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 NDUFB3O43676 98 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 CRLF1O75462 422 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 ADAP1O75689 374 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 GABRA2P47869 451 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD4-217ENST00000611848 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.3□□□□□ -1.24
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