RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	RGS11	O94810	467 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	MYF6	P23409	242 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	MYCNOS	P40205	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	GPR12	P47775	334 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	THBS3	P49746	956 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	TRAM1	Q15629	374 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	S1PR3	Q99500	378 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	BPNT1	O95861	308 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	CD37	P11049	281 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	TPBG	Q13641	420 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSME3-215	ENST00000592578	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RANBP1	P43487	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	UNC119	Q13432	240 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	LSAMP	Q13449	338 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	GNMT	Q14749	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	HMGN3	Q15651	99 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZMAT4	Q9H898	229 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SLC17A2	O00624	439 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ARSB	P15848	533 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CPE	P16870	476 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CRHBP	P24387	322 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SOX6	P35712	828 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	HSPA13	P48723	471 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	F2RL1	P55085	397 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	QRFP	P83859	136 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SVOP	Q8N4V2	548 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	MGLL	Q99685	303 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	NAPSA	O96009	420 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	MMD	Q15546	238 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578		A0A0A6YYD4	124 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ELANE	P08246	267 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	VDAC1	P21796	283 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ECI1	P42126	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	PSMD7	P51665	324 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	RAB25	P57735	213 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	ACTB	P60709	375 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSME3-215	ENST00000592578	FOXE3	Q13461	319 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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