RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	C3AR1	Q16581	482 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF737	O75373	536 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	VAX2	Q9UIW0	290 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM166B	A8MTA8	275 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	DEGS1	O15121	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	WNT5A	P41221	380 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	CD81	P60033	236 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	RTP5	Q14D33	572 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC25A6	P12236	298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	LHX4	Q969G2	390 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	DEFA4	P12838	97 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	LHX2	P50458	406 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743		A0A1B0GV90	55 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	IL2RG	P31785	369 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	HBG1	P69891	147 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	HBG2	P69892	147 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SELE	P16581	610 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	CLDN18	P56856	261 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	GNG3	P63215	75 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	RAMP3	O60896	148 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	CLDN1	O95832	211 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	OPN1MW	P04001	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	GZMH	P20718	246 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	COL10A1	Q03692	680 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743		Q6P435	159 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	FGFRL1	Q8N441	504 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	RNF224	P0DH78	156 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	CEACAM6	P40199	344 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	MAGEA5	P43359	124 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SERF2	P84101	59 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	ZXDA	P98168	799 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	P2RX4	Q99571	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNHG16-205	ENST00000587743	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG16-205	ENST00000587743	OR2H2	O95918	312 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG16-205	ENST00000587743	DDT	P30046	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG16-205	ENST00000587743	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNHG16-205	ENST00000587743	P2RY6	Q15077	328 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNHG16-205	ENST00000587743	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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