RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579466.1

MSI2-208, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 186 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-208	ENST00000579466	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466		A0A1W2PPK0	400 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	MAS1	P04201	325 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466		Q3ZCU0	254 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	MORN2	Q502X0	79 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	AWAT2	Q6E213	333 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	CST11	Q9H112	138 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	RETN	Q9HD89	108 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	RAB9B	Q9NP90	201 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	GAB2	Q9UQC2	676 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		7.4	□□□□□ -1.22
MSI2-208	ENST00000579466	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	FCN1	O00602	326 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	CIB2	O75838	187 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	BAG2	O95816	211 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	LIMS3	P0CW19	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	LIMS4	P0CW20	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	GABRB1	P18505	474 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	CX3CL1	P78423	397 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	DEFA5	Q01523	94 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	RAB40B	Q12829	278 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ACTBL2	Q562R1	376 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466		Q8N1Y9	231 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	CBR4	Q8N4T8	237 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	FAM46B	Q96A09	425 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	TMED9	Q9BVK6	235 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	JPT1	Q9UK76	154 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	STUB1	Q9UNE7	303 aa		7.39	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466		H7C2Y5	167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	RRH	O14718	337 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	HSPA12A	O43301	675 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	JTB	O76095	146 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	NDUFA3	O95167	84 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	TRGV3	P03979	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	MGMT	P16455	207 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ETV1	P50549	477 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ALDH3A2	P51648	485 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	HAGH	Q16775	308 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	LYPD6	Q86Y78	171 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	LFNG	Q8NES3	379 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	NPB	Q8NG41	125 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	SETD6	Q8TBK2	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466		Q96MT0	163 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	RDH12	Q96NR8	316 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	CKLF	Q9UBR5	152 aa		7.38	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	LALBA	P00709	142 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	CA2	P00918	260 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	IFNA6	P05013	189 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	GPR176	Q14439	515 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	STEAP3	Q658P3	488 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		7.37	□□□□□ -1.23
MSI2-208	ENST00000579466	APH1B	Q8WW43	257 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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