RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC17A2	O00624	439 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	LANCL1	O43813	399 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	YPEL1	O60688	119 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	CD33	P20138	364 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147		Q8N9W7	124 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	SOCS1	O15524	211 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	NAPSA	O96009	420 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	F2RL1	P55085	397 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	HMGN3	Q15651	99 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB11B	Q15907	218 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	S1PR3	Q99500	378 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	RGS11	O94810	467 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	PF4	P02776	101 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	GPR12	P47775	334 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	CLDN12	P56749	244 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC35B1	P78383	322 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	STPG2	Q8N412	459 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-222	ENST00000567147	AP4M1	O00189	453 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	LSAMP	Q13449	338 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	SSX1	Q16384	188 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	AK3	Q9UIJ7	227 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147		V9GY05	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	OR3A3	P47888	321 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	VEGFC	P49767	419 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	PSMD7	P51665	324 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM50B	P56557	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	CD69	Q07108	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	SOX6	P35712	828 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	HES5	Q5TA89	166 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	RITA1	Q96K30	269 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	RANBP1	P43487	201 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	PECR	Q9BY49	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	PDCD5	O14737	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	CEACAM6	P40199	344 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ACTB	P60709	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-222	ENST00000567147	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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