RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560514.1

TSPAN3-208, Transcript of tetraspanin 3, human

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN3-208	ENST00000560514	S100A13	Q99584	98 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	C8orf4	Q9NR00	106 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	LY6G6C	O95867	125 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	CNTFR	P26992	372 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF134	P52741	427 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TPPP2	P59282	170 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	PLGLA	Q15195	96 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	RETN	Q9HD89	108 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	SOX15	O60248	233 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	GPX5	O75715	221 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZP3	P21754	424 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	TTC23	Q5W5X9	447 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR52N1	Q8NH53	320 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	CDRT1	O95170	752 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	BAG2	O95816	211 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MT-ND4	P03905	459 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ETV1	P50549	477 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	PPP3R1	P63098	170 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MED21	Q13503	144 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	RITA1	Q96K30	269 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	RGS11	O94810	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MYL12A	P19105	171 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SERPINA2	P20848	420 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SOX2	P48431	317 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	GPR176	Q14439	515 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	RNLS	Q5VYX0	342 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	NPB	Q8NG41	125 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	RHOV	Q96L33	236 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	NDUFA3	O95167	84 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	HBZ	P02008	142 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	BDKRB2	P30411	391 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	CX3CL1	P78423	397 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	NDP	Q00604	133 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	GHSR	Q92847	366 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM80	Q96HE8	168 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	TRGV3	P03979	118 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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