RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 AHSPQ9NZD4 102 aa3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SPTA1P02549 2419 aa3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 NUMA1Q14980 2115 aa3.13□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ATMQ13315 3056 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 A0A096LPI6 279 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 GJE1A6NN92 205 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DISC1C4P0D8 188 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 C12orf77C9JDV5 145 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TEX46H3BTG2 121 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 BCKDKO14874 412 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 KDELR3O43731 214 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SOX15O60248 233 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TPST1O60507 370 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 UPK3AO75631 287 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ADAP1O75689 374 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 BRI3O95415 125 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM50AO95807 157 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MOSP00540 346 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 IGLV3-27P01718 113 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CT62P0C5K7 136 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR56A5P0C7T3 313 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ABOP16442 354 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF17P17021 662 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TBPP20226 339 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 FGF7P21781 194 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 AKR1C3P42330 323 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MAGEA12P43365 314 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RAB11AP62491 216 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DCDP81605 110 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 UNC119Q13432 240 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PNOCQ13519 176 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PEA15Q15121 130 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 COX19Q49B96 90 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF691Q5VV52 312 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 WDR59Q6PJI9 974 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PXT1Q8NFP0 134 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR2T4Q8NH00 348 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 COQ8AQ8NI60 647 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 NUBPLQ8TB37 319 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RORBQ92753 470 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 BMFQ96LC9 184 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR8B4Q96RC9 309 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 BEX2Q9BXY8 128 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CHST5Q9GZS9 411 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MMP26Q9NRE1 261 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 USE1Q9NZ43 259 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 U3KQA8 63 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PTPN13Q12923 2485 aa3.12□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa3.11□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MGAQ8IWI9 3026 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms