RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557013.1

SAMD4A-211, Transcript of sterile alpha motif domain containing 4A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SAMD4A, Length 3,637 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4A-211ENST00000557013 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 H3BML4 177 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 MSTNO14793 375 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TOMM40O96008 361 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 IGLC2P0DOY2 106 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 IGLC3P0DOY3 106 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ARR3P36575 388 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TNFRSF4P43489 277 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CRYBA4P53673 196 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 FBXW4P57775 412 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 LYPD6Q86Y78 171 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 BORCS7Q96B45 105 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 SARAFQ96BY9 339 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 FAM206AQ9NX38 181 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 VDAC3Q9Y277 283 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 FAM166BA8MTA8 275 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 NUDT3O95989 172 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CBLN1P23435 193 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TMEM50BP56557 158 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 LHX4Q969G2 390 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 GPR84Q9NQS5 396 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 OR5B21A6NL26 309 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ALG1L2C9J202 215 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 IL3RAP26951 378 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 DYNLT3P51808 116 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CLDN18P56856 261 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 YPEL5P62699 121 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 PAFAH1B2P68402 229 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TGFBR3Q03167 851 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 NSDHLQ15738 373 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 MPV17L2Q567V2 206 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 Q56UQ5 140 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 BOD1Q96IK1 185 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 DMDP11532 3685 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 RP1P56715 2156 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 M0R1X1 148 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 APOA2P02652 100 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TMEM225BP0DP42 221 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TCN2P20062 427 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 DRD1P21728 446 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ADMP35318 185 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CLDN17P56750 224 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CKS1BP61024 79 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 CARD17Q5XLA6 110 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 LCN12Q6JVE5 192 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 FAM57BQ71RH2 274 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 SFRP2Q96HF1 295 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 DERL1Q9BUN8 251 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 OR10A2Q9H208 303 aa7.06□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 MS4A18H0YCH9 400 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TAS2R46P59540 309 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 PLP1P60201 277 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 PAX2Q02962 417 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ZNF154Q13106 437 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 GABRA6Q16445 453 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ASB10Q8WXI3 467 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 RSG1Q9BU20 258 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 THYN1Q9P016 225 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMD4A-211ENST00000557013 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms