RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf152Q5JTZ5 239 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEAP2Q969E1 77 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TENM3Q9P273 2699 aa15.4■□□□□ 0.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C15orf65H3BRN8 121 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM50BP56557 158 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR8H3Q8N146 312 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR18Q8N4B5 295 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C8orf31Q8N9H6 132 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTX4Q96A99 478 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.39■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0B4J203 849 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMB11A5LHX3 300 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C12orf77C9JDV5 145 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV3-7P01780 117 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB6AP20340 208 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MXD1Q05195 221 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPF1Q92782 380 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB22AQ9UL26 194 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MOB4Q9Y3A3 225 aa15.38■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOCS1O15524 211 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGS11O94810 467 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GABARAPO95166 117 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HBZP02008 142 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTF1Q16619 201 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSF4Q9ULV5 492 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.37■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM127O75204 238 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCAND1P57086 179 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LSM3P62310 102 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UTF1Q5T230 341 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00311Q8N616 119 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBALD1Q8TB05 177 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SETD6Q8TBK2 473 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALMQ96C23 342 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.36■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RYR3Q15413 4870 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB27BO00194 218 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSD17B6O14756 317 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC6A1P30531 599 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THBS3P49746 956 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NCS1P62166 190 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HES1Q14469 280 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF329Q86UD4 541 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR1L1Q8NH94 360 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFP57Q9NU63 452 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JPT1Q9UK76 154 aa15.35■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PPE3 182 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL21EPA6NDL7 271 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXNL1O43396 289 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAPSAO96009 420 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VEGFCP49767 419 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTD2P86397 168 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MOGAT2Q3SYC2 334 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STEAP3Q658P3 488 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MOB3BQ86TA1 216 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR56B4Q8NH76 319 aa15.34■□□□□ 0.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGF16O43320 207 aa15.33■□□□□ 0.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYCNOSP40205 109 aa15.33■□□□□ 0.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VBP1P61758 197 aa15.33■□□□□ 0.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD69Q07108 199 aa15.33■□□□□ 0.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms