RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0J9YWU9	116 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	OR11H12	B2RN74	326 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	FKBP6	O75344	327 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	TPPP	O94811	219 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	HTR1A	P08908	422 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	CT45A6	P0DMU7	189 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	CT45A5	P0DMU8	189 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	CT45A7	P0DMV0	189 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	GAPT	Q8N292	157 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	NDE1	Q9NXR1	346 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ING4	Q9UNL4	249 aa		9.11	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	NUPR2	A6NF83	97 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557		J3QLW9	94 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SLC16A6	O15403	523 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SPINT2	O43291	252 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	T-ENOL	P0DO92	83 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF19	P17023	458 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1E1	P36543	226 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00205	P59089	165 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ORAI1	Q96D31	301 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	GPER1	Q99527	375 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		9.1	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	AQP12B	A6NM10	295 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	CA2	P00918	260 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	TFAP2A	P05549	437 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINA2	P20848	420 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	POC5	Q8NA72	575 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	NEK7	Q8TDX7	302 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	NRBF2	Q96F24	287 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	C4orf36	Q96KX1	117 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	IL36G	Q9NZH8	169 aa		9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
BBS1-222	ENST00000533557	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557		H0YJW9	148 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	PROP1	O75360	226 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	RAB3A	P20336	220 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	SOX2	P48431	317 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	PSG5	Q15238	335 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	METTL9	Q9H1A3	318 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	RNF150	Q9ULK6	438 aa		9.08	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GVY2	172 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	DAPL1	A0PJW8	107 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	MSGN1	A6NI15	193 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	ST8SIA5	O15466	376 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	FAM107A	O95990	144 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	PLGLA	Q15195	96 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	MPV17L	Q2QL34	196 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	LYG2	Q86SG7	212 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	NSL1	Q96IY1	281 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	AASS	Q9UDR5	926 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	DHDH	Q9UQ10	334 aa		9.07	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	BMPR1B	O00238	502 aa		9.06	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	YPEL1	O60688	119 aa		9.06	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	MNAT1	P51948	309 aa		9.06	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	TNFRSF9	Q07011	255 aa		9.06	□□□□□ -0.96
BBS1-222	ENST00000533557	TMED1	Q13445	227 aa		9.06	□□□□□ -0.96

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